需要注意的是，眼药水要悬空滴，别让瓶口接触到睫毛，防止污染。滴完之后要闭眼1~2分钟，但切勿用力闭眼，以防将药液挤出。眨眼会增加药水排泄的速度，每眨眼一次，约有两微升的药水经由鼻泪管排泄掉，闭目养神几分钟可以增加药水与眼球接触的时间，具有促进药效的作用。滴眼药水时不要直接将药液滴在角膜上，也就是黑眼球上，以免药液刺激角膜，导致眨眼次数增多，会使药液外流而降低疗效。
使用不同的眼药水要间隔10分钟，一次点一滴即可，因为眼药水一滴的量约16微升左右，结膜囊内可贮存的容量一般只有12微升左右，一次滴好几滴等于浪费。眼药水内一般都含有防腐剂，滴得太过频繁会对眼球表面造成伤害。
广告中明星常将眼药水滴在眼球上。其实这种做法是错误的，不仅不能起到治疗的效果，还会刺激角膜，引起不适。
